曾文溪流域魚類分布資料庫
資料來源:中研院動物所魚類生態與進化研究室
從1993年至1998年6月，共分3年調查曾文溪流域的魚類相，迄今累計共記錄到46科120種，較過去文獻中所記錄之 5科27種增加甚多，主要是因為過去在曾文溪的下游及河口並無任何調查之魚種資料。其中包括3種新種，6 種台灣新記錄種，7種台灣特有種，及14種外來種。
本研究計畫共分三年進行，第一年度先進行曾文溪流域全域（共
19點）魚類相作定性為主之初步調查，以建立上、中、下游（含河口）及出海口附近之魚類組成之資料。第二年度起則根據第一年度調查結果選擇8個固定測站（達邦、里佳、山美、達谷、玉井、西港、國聖、河口等）進行長期魚類監測、收集定量資料；但由於上游之四測站重覆性太高，第三年度起乃刪減達邦及山美二測站，並在玉井處另增加一玉井中正橋測站，以及下游自1995年11月起改用底拖網進行定量資料收集。綜合而言，曾文溪上游除外來種外，本土之魚種雖少，但尚稱穩定；中游污染較嚴重，魚種雖不少但不穩定；下游則因海水魚入侵而使魚種多而複雜，群聚亦不穩定，此外，結果亦可知曾文溪水域魚類受下列人為因子之影響：
(1) 水庫與攔沙壩 － 使許多雙向洄游魚種阻絕其洄游路徑。
(2) 水土保持不良 － 濫墾及濫伐使土壤蓄水能力變差，降低對河川的供水能力，對魚類之生存威脅甚大。
(3) 外來種的入侵 － 在曾文水庫及以下水域均相當普遍而嚴重，造成區域內原生種魚種在生存上之嚴重威脅。
(4) 釣捕壓力 － 遊憩之水庫筏釣、及漁民之刺網、拖網造成過漁壓力。
- 1993年7月至1994年6月:
從曾文溪上游至河川中下游共調查約20處地點，初步共記錄有28科70種，較過去文獻中所記載之5科27種增加甚多。這70種中包括初級淡水魚24種，及至少10種之台灣特有種。各測站中，以河口區所記錄到之35種為最多。上游地區魚類相則較單純。魚種組成以[魚蝦]虎科（Gobiidae）佔21種最多，其中包括可能為新種之3種[魚蝦]虎及3種台灣新記錄種。此3個未發表之新種為短吻[魚蝦]虎（Rhinogobius sp. T1)、斑帶吻[魚蝦]虎（Rhinogobius sp. T5）以及南台吻[魚蝦]虎（Rhinogobius sp. T6)；3個新記錄種則為小擬[魚蝦]虎（Pseudogobius masago)、裸頸縞[魚蝦]虎（Tridentiger nudicervicus）與綠斑銜鯊（Acentrogobius chlorostigmatoides）。鯉科（Cyprinidae）佔15種，為曾文溪流域第二大之魚科。
外來種的入侵，在曾文水庫及以下水域均相當普遍而嚴重，曾文溪中游玉井、善化等地區吳郭魚族群於數次採集數目常高達90%以上，已造成區域內原生種魚種在生存上之嚴重威脅。初級淡水魚的分布下限，會隨著河川逕流量與潮汐變化而改變。雙向洄游魚種中，以鱸鰻（Angullia mamorata）與斑帶吻[魚蝦]虎（Rhinogobius sp. T5）數量較多，分布亦較廣，但曾文水庫及南化水庫明顯地限制該魚種之分布。
台灣西南部之雨量大多集中夏季，秋冬則為明顯之旱季。然而1994年夏季以後，持續乾旱，故在1993年冬季時，曾文水庫大埔地區淹沒區面積僅達1993年夏季調查時的1/6，1994年元月更減至約1/20，四月時，大埔地區的水庫區已呈乾床之情形。由於水資源利用對河川逕流量影響甚大，旱季時（10月∼3月）如何減少河川發生乾枯之機會，將是日後曾文溪魚類生態穩定程度之重要課題。
- 1994年7月至1995年6月:
今年度以去年度調查資料為依據選定8個測站進行定點、定期（每2個月1次）之魚類群聚之監測。在魚類相方面，迄今累計共已記錄到41科105種魚類，其中除了9科23種純淡水魚外，其餘32科82種皆屬河海洄游或河口魚種。在魚種組成中，以[魚蝦]虎科（Gobiidae）佔28種最多，包括新種之3種吻[魚蝦]虎（Rhinogobius）之新種及4種台灣新記錄種（小擬[魚蝦]虎 Pseudogobius masago、裸頸縞[魚蝦]虎 Tridentiger nudicervicus、綠斑[魚蝦]虎 Acentrogobius chlorostigmatoides、岩叉舌[魚蝦]虎 Glossogobius celebius）；另有2種波魚科之新記錄種（小雙邊魚 Ambassis miops、康氏雙邊魚 Ambassis commersoni）。鯉科（Cyprinidae）佔17種，為曾文溪流域第二大之魚科。至於群聚變動之分析目前已累計5次完整之資料，包括各站之水文與各魚種之體長大小及尾數等。由此等資料初步來看，曾文溪上游之魚種雖少，但尚稱穩定；中游污染嚴重，魚種雖不少但不穩定；下游則因海水魚入侵而使魚種多而複雜，群聚亦不穩定。總之定量資料因尚未滿一年，故其變化與環境因子之確實關係尚不能斷言。
經過二年來之調查，已知曾文溪水域魚類受下列人為因子之影響：
(1)水庫與攔沙壩 -- 曾文水庫為曾文水庫上游原生魚類相分佈之界限（如：[魚固]魚、台灣石磓、馬口魚、花鰍等），並且在集水區上游主流有5個攔沙壩，支流16座（不含將新建之十餘座在內）使許多雙向洄游魚種阻絕其洄游路徑。
(2)水土保持不良 -- 使冬季乾旱期之溪床乾涸，河水逕流量銳減，使水溫增高，加強污染效應，對魚類之生存威脅甚大，且使海水魚（如牛尾、沙[魚梭]及鯔、[魚蝦]虎、鯡等科魚類）入侵河口20∼30公里（至西港一帶）；反之夏天暴雨，水量遽增，淡水魚分佈下限可延至國聖（翹嘴紅[魚白]、白鱎、四鬚[魚八]等）。故由此海水魚及純淡水魚分佈上下限之大幅變動，亦可反映出曾文溪水域環境之不穩定。
(3)水污染 -- 鄉鎮污染使水庫以下受污染；玉井、善化旱季時較嚴重。
(4)外來種的入侵 -- 在曾文水庫及以下水域均相當普遍而嚴重，曾文溪中游玉井、善化等地區吳郭魚族群於數次採集數目常高達90%以上，已造成區域內原生種魚種在生存上之嚴重威脅。
(5)釣捕壓力 -- 原住民以魚叉捕[魚固]魚，遊憩之水庫筏釣、中下游之遊釣、及漁民之刺網造成過漁壓力；上游之違法電魚偶有所聞，而下游之電拖網則頗為嚴重。
- 1997年7月至1998年6月:
曾文溪流域的魚類部份迄今累計共記錄到46科120種，較過去文獻中所記錄之 5科27種增加甚多，主要是因為過去在曾文溪的下游及河口並無任何調查之魚種資料。其中包括3種新種，6 種台灣新記錄種，7種台灣特有種，及14種外來種。三種新種均屬畊虎科中的褐吻畊虎，它們分別是短吻畊虎（Rhinogobius xanthomaculatus）、斑帶吻畊虎（Rhinogobius maculafasciatus）、南台吻畊虎（Rhinogobius nantaiensis）（陳&邵, 1996）。其中除短吻畊虎在西部主要河川的上游均有分佈外，另外的斑帶吻畊虎及南台吻畊虎兩種，目前均僅分布在曾文溪及高屏溪較高海拔的水域（陳, 1994），因此彌足珍貴，應予保護。七種台灣特有種中，台灣間爬岩鰍、台灣石磓、粗首𡢞、短吻鐮柄魚、及台灣馬口魚為普遍存在於台灣，除東部以外之水系；埔里中華爬岩鰍則只出現在中南部地區，何氏棘磇則只在東部及南部，而以曾文溪為其北界。
上游魚類共25種，其中以�摀膜峊x灣石磓為優勢種，此二種的稚魚幾乎整年都會出現，故推測其生殖期為全年，但稚魚出現以夏季為多，餘較少，故上游魚類的生殖活動除可能受水溫及食物量兩項因子所控制外 (張, 1994)，曾文溪的流量即降雨量亦可能為其主要的控制因子。
中游魚類共21種，中游地區因受到水庫攔水之影響，溪水變淺，流速遲滯，因此水溫較高，溶氧降低，故所調查記錄到的魚種，多以湖泊棲性的魚類為主，如鯉、鯽、團頭魴或吳郭魚等。
下游魚種高達94種，佔所有魚種的78%。其組成受取樣及乾溼季之影響甚鉅，即旱季時，海水魚可入侵20公里 (至西港一帶)，故曾文溪下游魚類群聚之變動受季節性之影響頗大。
綜合而言，曾文溪上游除外來種外，本土之魚種雖少，但尚稱穩定；中游污染較嚴重，魚種雖不少但不穩定；下游則因海水魚入侵而使魚種多而複雜，群聚亦不穩定，此外，結果亦可知曾文溪水域魚類受下列人為因子之影響：
(1) 水庫與攔沙壩 － 使許多雙向洄游魚種阻絕其洄游路徑。
(2) 水土保持不良 － 濫墾及濫伐使土壤蓄水能力變差，降低對河川的供水能力，對魚類之生存威脅甚大。
(3) 外來種的入侵 － 在曾文水庫及以下水域均相當普遍而嚴重，造成區域內原生種魚種在生存上之嚴重威脅。
(4) 釣捕壓力 － 遊憩之水庫筏釣、及漁民之刺網、拖網造成過漁壓力。